卫生部有关人士说，微生物引起的食源性疾病是影响我国食品安全的最主要因素，在一些地区，由于微生物引起的食物中毒已成为危害学生健康的主要问题。此外，农业种植、养殖业的源头污染对食品安全的威胁越来越严重，国家明令禁止生产和使用的毒鼠强等农药引起的食物中毒时有发生。
　　卫生部有关人士还说，我国中小城市、乡镇及大中城市结合部的一些无照企业和个体工商户及家庭式作坊，成为食品制假售假的集散地，直接危害了人民群众的身体健康和生命安全，社会各界反响强烈。工业污染导致环境恶化，也对食品安全构成严重威胁。如水源污染导致食源性疾患的发生，海域的污染直接影响海产品的卫生质量。
　　随着时代的进步，食品工业中应用新原料、新工艺给食品安全带来了许多新问题，如现代生物技术、益生菌和酶制剂等技术在食品中的应用、食品新资源的开发等，这既是国际上关注的食品安全问题，也是我国亟待研究和重视的问题。
　　卫生部有关人士还提出，随着科技的进步和检验技术的发展，原先未知的有毒有害物质正被人们逐步认识，对食品安全的控制措施和技术提出了更高的要求，如导致疯牛病的阮病毒、食物中的二恶英污染、酱油中三氯丙醇污染等问题。
　　防止食品污染、保证食品安全、维护消费者的健康和权益已成为我国的一件重要国策。
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